纳入居民基本医疗保险特殊疾病门诊管理的病种分一类和二类：
一类（19种）：1.甲状腺功能亢进或减退症；2.糖尿病伴眼部（心、脑、肾、周围神经病变等慢性）并发症；3.高血压2级以上伴心（脑、肾等）损害并发症；4.冠状动脉粥样硬化性心脏病；5.肺源性心脏病；6.风湿性心脏病；7.先天性心脏病；8.肝硬化失代偿期；9.脑血管意外后遗症；10.帕金森病；11.重症精神病（精神分裂症、双相情感障碍（抑郁症）、偏执性精神病、分裂情感性障碍、癫痫所致精神障碍、精神发育迟缓伴精神病性障碍）；12.癫痫；13.结核病抗结核治疗；14.艾滋病；15.强直性脊柱炎；16.矽肺参期；17.儿童血友病；18.儿童免疫性血小板减少症；19.儿童噬血细胞综合征。
二类（11种）：1.恶性肿瘤；2.白血病（含骨髓异常增生综合征）；3.慢性肾脏病3期及以上；4.再生障碍性贫血；5.器官移植术后抗排异治疗；6.系统性红斑狼疮；7.地中海贫血；8.白塞病；9.肝豆状核变性；10.普拉德-威利综合征；11.原发性生长激素缺乏症。
